Research

프로테오믹스 요소기술개발

인체의 2만5천여개의 유전자에 의해 발현되는 단백질은 20만~200만개로 추정되고 생체 조건에 따라 그 기능과 구조가 역동적으로 변화한다. 그러한 단백질을 연구하기 위해 다양한 프로테오믹스 분석기술을 활용하고 있으며, 아울러 새로운 기술도 개발하고 있다. LC-MS를 기본으로 하는 단백체 분석 플랫폼을 구축하였으며, SILAC, TMT, iTRAQ, mTRAQ 등의 다양한 정량 방법을 수행하고 있다.

특히 우리 연구실에서는 동위원소표지식 정량방법중의 하나인 mTRAQ 상대정량분석법을 손수 개발하여 암단백체 분석에 활용하였으며, genome이나 transcriptome의 정보를 바탕으로 하여 단백질의 양, 또는 변이를 바로 확인하는 STaLPIR 방법도 개발하였다.


mTRAQ 정량법의 특성


Schematic workflow of the STaLPIR proteogenomic method

질병 바이오마커 발굴

질병발생은 프로테옴의 변화를 수반하며, 그러한 프로테옴을 분석함으로써 유용한 표지, 표적을 발굴할 수 있다 특히 질환 바이오마커는 질병의 조기진단, 예후, 특정 화학요법의 적합성에 대한 검토뿐만 아니라, 신약 개발 단계에서 성공 여부를 미리 판별할 수 있게 약동력학을 이용한 독성 및 부작용을 검증하는 데에도 유용하게 사용될 수 있다.

우리 연구실에서는 환자로부터 유래한 조직 및 혈액 시료를 mTRAQ, TMT, spectral counting, LFQ 등의 다양한 프로테옴 정량 방법과, nano-LC-ESI-MS/MS 등의 질량분석 방법으로 분석하여 바이오마커 후보를 발굴하고, western blot, real time PCR, immunohistochemistry 등의 방법으로 검증한다.

주요 질병대상은 대장암, 위암, 뇌종양 같은 종양과 나이관련황반변성이다.


암 마커 발굴 모식도


마커 발현양 측정

단백질 Post-translational Modification 분석법 개발

단백질의 아미노산 서열은 유전자의 염기서열로 결정되지만, 단백질이 translation 된 후에도 다양한 수식화 (PTM)이 일어날 수 있으며, 그러한 PTM에 따라 단백질의 수명, activity, localization등이 변하게 된다.

인산화, 당쇄화 등의 일반적인 PTM 분석을 수행하고, 특히 N-terminal acetylation 분석법을 개발하고 있다.


단백질 N-term이 acetylation되었을 때의 화학식

줄기세포유래 분비단백체 분리 및 분석 플랫폼 구축

세포를 FBS가 있는 배지에서 배양한 후 분비단백질을 분리 분석하는 방법을 개발하고 있다. 세포배양 시 배지에 methionine의 analog의 하나인 azidohomoalanine 을 넣고 키운 다음 아자이드-알킨 고리화첨가 반응 (Copper-Catalyzed Azide-Alkyne Cycloaddition, CuAAC)을 통해 새로 합성된 단백질만을 분리하여 분석하는 원리를 활용한다.


새로 합성된 단백질의 결합 특이성 확인

News
2018.08.01LMP alumna 신지혜박사 일본학술진흥원(JSPS)의 박사후연수 장학금 수혜. 정확하게는 JSPS Postdoctoral Fellowships for Research in Japan (standard program)이며, 2년간 (2018.09~2020.08) 지원받게 된다고 알려옴
2018.06.01안희성 박사학위 심사 통과
2018.05.18LMP 홈페이지 개편
2018.04.29Prashant 결혼
2014.03.16염정훈군 결혼
2014.01.18박성준 박사 득남. 오랜 기다림 끝에 박성준 박사가 아드님을 낳았습니다.
2013.12김준석 박사, TV 출연하다. SBS 모닝 와이드 3부. MRM 국제공동연구결과가 Nature Methods에 실리면서 작은 양의 시료로 여러가지 단백질을 측정할 수 있음을 약간의 과장을 섞어 대중적인 용어를 사용하여 인터뷰한 내용입니다.
2013~2014Lysine methylation을 분석한 공동연구 논문이 2013년 6월 Cancer Cell에 나간 이후, 2014년 초까지 Molecular Cell, Nature Chemical Biology, Nature Methods, Nature Communations까지 무려 다섯편의 공동연구 논문이 Cell 및 Nature 자매지에 나갔습니다. 이제는 직접 내자구요.
2013.08김혜정 박사가 8월 7~10까지 미국 NJ에서 열렸던 재미한인과학기술자협회 주간 2013년 UKC학회에 참가하고 소식을 보내왔습니다. (학회 및 미국 랩 사진) 미국에 가기 전에 LMP에서 했던 일을 포스터를 만들어서 발표를 하고, 최우수 포스터상에 뽑히는 영광을 얻었습니다. 다음은 김혜정 박사의 전언입니다. ------------- 몇몇 연구소와 교수님들께서 큰 관심을 보이셨고 연구의 흐름이나 실험기법등에 대한 문의를 많이 하셨습니다. KIST 분자프로테오믹스연구실을 많이 홍보하였습니다. 또한 문길주 원장님도 여러번 뵈었습니다. 흐뭇하게 연구를 지켜보시며 지도교수님이 누구시냐고 물어보셔서 "테라그노시스 이철주 책임연구원님이십니다"라고 씩씩하게 말씀드렸습니다.
2013.04안영희 박사 20일 결혼. 4:30 베라체웨딩컨벤션 1층 팰리스홀 [모바일청첩장]
2013.03한국단백체학회 13회 정기학술대회에서 신지혜학생 우수포스터상 (summa cum laude) 수상. (3/29) 톱다운단백체학실험실의 천동희학생도 우수포스터상 수상. [이미지갤러리]
2013.03이영주 학생이 학업을 포기하고 귀향했습니다. 뭔가 다른 일을 하고 싶답니다.
2013.02김규태 학생과 강민정 학생이 KIST-고려대학교 학연 석사과정을 졸업하였습니다. 양원석 박사가 서울대학교 융기원으로 자리를 옮겼습니다.
2013.02창립 47주년 기념식에서 이철주 박사님이 10년 근속상을 수상하였습니다. (2/7)
2012.08양원석 학생이 박사과정을 마치고 졸업하였습니다.
2012.08강운범 박사가 Harvard University에 Postdoctoral fellow로 갔습니다.
2012.07김혜정 박사가 Vanderbilt University에 Postdoctoral fellow로 갔습니다.
2012.02신지혜 학생이 석사과정을 마치고 졸업하였습니다. 동시에 KIST-연세대학교 박사과정에 진학하였습니다.
2012.02Kabir 학생이 박사과정을 마치고 졸업하였습니다.
2012.02김혜정 학생이 박사과정을 마치고 졸업하였습니다.
2012.06이철주 박사님이 과학기술연합대학원대학교로부터 우수강의상을 수상하였습니다. (6/29)
2011.02서의진 학생이 석사과정을 마치고 졸업하였습니다.
2010.03이철주 박사님께서 책임연구원이 되셨습니다.
2010.02Nithyananda Thorenoor 학생이 박사과정을 마치고 졸업하였습니다. 졸업과 동시에 Academic excellent award를 수상하였습니다.
2010.02강운범 학생이 박사과정을 마치고 졸업하였습니다.
2009.02KIST 43주년 기념 포상에서 이철주 박사님께서 '박원희 연구상'을 수상하셨습니다.
2009.02KIST 43주년 기념 포상에서 박사과정 김혜정?학생이 학연 협동과정 우수상을 수상하였습니다.
2008.08.20박사과정 강운범 학생이 학연장학생으로 선정되었습니다.
2008.08안영희 학생이 박사과정을 마치고 졸업하였습니다.
2008.0228일 홍석호 학생이 석사과정을 마치고 졸업하였습니다.
2008.02KIST 42주년 기념 포상에서 박사과정 강운범 학생이 학연 협동과정 우수상을 수상하였습니다.
2007.08Marquis Who's Who는 이철주 박사님의 생물학적 업적을 인정하여 후즈후 아시아에 이어 Who'sWho Silver Anniversory Edition of Who's Who in the World (2008년)에도 등재하였습니다.
2006.12이철주 박사님께서 생물학자로서 지금까지의 연구수행 및 논문 실적 등을 인정받아 2007-2008 마르퀴즈 후즈후 과학기술인명사전 (Marquis Who's Who in Science and Engineering)에 등재되었으며, 또한 2007년에 처음으로 발행되는 후즈후 아시아 인명사전 (Who's Who in Asia) 에도 동시에 등재되었습니다.
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KIST 주변 지도

오시는 길

KIST L7235 (7동, 2층, 35호)

  • 캠퍼스 안에서는 택시나 버스 같은 대중교통을 이용할 수 없음.
  • 경비실에서 신분증과 출입증을 교환. 출입증 발급 후 캠퍼스 내 차량 진입은 가능
  • 지하철 등 대중교통은 北門을, 택시는 中門을 이용하는 것이 편리함
  • 연구동에 출입할 때 출입증을 출입문의 센서에 1초 이상 접촉하여야 열림
지하철 이용시 (北門):
  • 6호선 상월곡역 4번출구 -> (도보 5분) -> 북문 (경비실에서 출입증 발급) -> (기숙사 뒷길, 도보10분) -> L7
택시 이용시 (中門)::
  • 중문으로 오셔서 하차 후 경비실 출입증 발급
  • 택시기사가 정확한 위치를 모를 경우 홍릉 가스충전소 맞은편 숲길로 700 m 들어가면 된다고 알려줌
  • 택시를 엉뚱한 방향으로 가게 하는 대표적 사례
    • "과학기술원" 갑시다 -> 카이스트 경영대학원으로 데려다 줌
    • "과학기술대"로 갑시다 -> 태릉의 과학기술대 (예전 산업대) 로 데려다 줌
    • "과학기술연구원"으로 갑시다 -> 카이스트 경영대학원으로 데려다 줌. 택시기사는 일반적으로 과기연과 과기원을 구분 못함
    • "키스트" 갑시다 -> 택시기사는 일반적으로 키스트와 카이스트를 구분 못함
  • 택시기사가 알아듣기 쉬운 설명
    • "홍릉 가스충전소" 갑시다. 그 맞은편 숲길로 들어가면 됩니다.
    • "고려대-경희대 사이"에 있는 흥릉 가스충전소로 갑시다.
    • 지금 이 글을 모바일로 읽고 있나요? 위의 지도를 택시기사한테 보여주세요.
자가차량 이용시 (北門):
  • 네비게이션 도착지 [한국과학기술연구원 北門]
  • DB에 없는 경우 입력할 주소 [성북구 하월곡동 12-21]
  • 경비실에서 출입증 발급 후 L7쪽으로 이동 후 주차
자가차량 이용시 (正門 -> 中門):
  • 네비게이션 도착지 [한국과학기술연구원 正門]
  • DB에 없는 경우 입력할 주소 [동대문구 청량리동 산 1-1]
  • 정문은 경비만 있고 그냥 통과하며 700m 산길을 더 들어가야 중문 경비실 나옴


KIST 캠퍼스 지도

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